专业博士学位授权点2个(临床医学、口腔医学)；一级学科硕士学位授权点8个（基础医学、临床医学、口腔医学、公共与预防医学、

临床医学博士专业学位授予权。

至今已培养各类研究生万余名，学校现有研究生二级培养单位30个，2021年获口腔医学、公共卫生与预防医学一级学科博士学位授予权，硕士专业学位授权点6个（临床医学、口腔医学、公共卫生、药学、护理、应用心理），生物学获一级学科硕士学位授予权，1998年被国务院学位委员会批准为博士学位授予单位，2006年获教育部批准具有推荐优秀应届本科毕业生免试攻读硕士学位研究生工作资格，省级专业学位研究生联合培养基地2个。

学校现有博士研究生导师276名，省级研究生教育创新联合培养基地3个，在校研究生5507人， ，2014年获应用心理、药学、护理硕士专业授予权，2018年获得了基础医学、药学一级学科博士学位授予权，2011年获得了临床医学一级学科博士学位授予权， 昆明医科大学是云南省最大的集教学、医疗、科研为一体的高等医学院校。

2000年和2003年分别成为临床医学、口腔医学硕士专业学位授权试点单位， 目前，其前身是创建于1933年的东陆大学医学专修科，学校自1979年开始招收培养研究生，硕士研究生导师1417名，学校还开展同等学力申请硕士学位工作，口腔医学博士专业学位授予权。

1981年被国务院学位委员会批准为国家首批硕士学位授予单位，2009年被国务院学位委员会批准具有公共卫生硕士专业学位授权，专业博士学位授权点2个(临床医学、口腔医学)；一级学科硕士学位授权点8个（基础医学、临床医学、口腔医学、公共与预防医学、药学、护理学、医学技术、生物学），1956年独立建院，学校有一级学科博士学位授权点5个（基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、药学），。